據了解，籌建方案主要包括二級學院名稱，如“平潭大學××學院”，以及發展目標、建設規劃、校區規劃等。省教育廳要求，各校應會同臺灣合作院校組織專家組對平潭綜合實驗區產業發展、技術創新與人才需求情況進行深入調研，并與平潭綜合實驗區管委會及有關部門進行溝通協調，確保二級學院籌建方案科學合理、切實可行。

根據省重點建設高校與平潭綜合實驗區管委會簽訂的合作協議，福州大學、福建師范大學、福建中醫藥大學的二級學院應在2012年前先期進駐平潭大學。

據悉，省教育廳將對各校上報的二級學院籌建方案進行匯總后組織編制平潭大學籌建計劃，并會同平潭綜合實驗區管委會、省直有關部門和各有關高校研究制訂建設模式、管理與運行機制及支持政策措施等。